AI for Science:人工智能加速科学发现新范式

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简介

2026年AI for Science兴起,AlphaFold3驱动的ContactSeek框架登上《自然》,人工智能正成为加速基因编辑、蛋白质研究与新药发现的科学新范式。

2026年,“AI for Science(科学智能)”从口号变为现实,人工智能正加速成为科学发现的新范式。据腾讯新闻2026年8月4日报道,北京大学生命科学学院伊成器课题组与华东师范大学李大力课题组,在《自然》(Nature)发表题为“Precise DNA base editing using AlphaFold3-based contact modelling”的研究论文,提出基于AlphaFold3接触概率(contact probability, CP)的AI框架ContactSeek,显著提升了基因编辑工具的精准性。这一成果是AI深度参与生命科学发现的标志性事件。

AlphaFold3:从“画结构”到“感知互作”

AlphaFold自2021年惊艳科学界以来,已能预测数以百万计的蛋白质结构,并因此荣获2024年诺贝尔化学奖。2026年的新进展在于,研究者发现AlphaFold3的价值不止于生成三维结构——其内部的“接触概率”输出,能比静态结构更灵敏地捕捉分子互作变化。研究团队让AlphaFold3分别预测碱基编辑器在“在靶”与“脱靶”位点的DNA-RNA-蛋白质三元复合物,结果发现:即便序列仅存在单碱基错配,结构预测往往看不出差异,而接触概率(CP)却会明显下降。正是这一高维表征中的细微信号,成为提升编辑特异性的关键线索。

ContactSeek:用AI重新设计基因编辑器

基于上述洞察,研究者整合AlphaFold3的接触概率与高通量测序获得的脱靶编辑信息,构建了AI驱动的ContactSeek框架。该框架系统识别Cas蛋白与脱氨酶中决定编辑特异性的关键氨基酸残基,据此对碱基编辑工具进行工程化改造。结果显示,优化出的突变体Cas9(K1020D)–TadA8e(F156D)(命名为ABE8e-DD),在保持高效在靶编辑的同时,显著降低了DNA与RNA脱靶效应;该框架也可推广至胞嘧啶碱基编辑器,证明其通用性。这为“精准设计基因编辑器”提供了可解释、可验证的新范式。

更广阔的图景:AI成为科学发现的引擎

除基因编辑外,2026年AI for Science的整体生态持续扩张。EMBL与谷歌DeepMind等机构持续扩充AlphaFold数据库,纳入数千万蛋白质复合物预测,优先覆盖人类健康与世界卫生组织重点病原体,服务全球科研;奥地利ISTA等团队则提出“实验引导的AlphaFold”,让模型结合核磁共振等实验数据,预测蛋白质的动态构象集合,修正传统静态结构训练的局限。从蛋白质设计、药物筛选到材料与气候建模,人工智能正在把科学发现的循环——提出假设、设计实验、分析结果——压缩到前所未有的速度。可以预见,AI for Science将成为继实验、理论、计算之后的“第四范式”的重要引擎。

2026年的AI for Science实践表明,人工智能的价值远不止于聊天与生成内容。当AlphaFold3的接触概率被用于重新设计基因编辑器,当AI框架可解释、可验证地指导实验,科学发现正迎来人类与机器协同的新纪元。未来,懂科学的AI与懂AI的科学家,将共同定义下一个十年的突破边界。